Entre los múltiples intereses, la asociación dedica una notable energía al estudio y conservación de anfibios y reptiles. Grupo faunístico donde se ha alcanzado un alto grado de especialización, dando respuesta a una necesidad histórica en la comunidad de Extremadura.
El primer paso en la conservación de estas especies es tener un conocimiento claro del estado de sus poblaciones. Muchas de las propuestas de proyecto y actividades van encaminadas a recopilar información sobre la distribución real de estas especies, aún desconocidas para todo el territorio extremeño, así como a identificar y registrar las amenazas que existen para la viabilidad de sus poblaciones. De esta forma, Arbórea está ampliando y actualizando el Atlas de Anfibios y Reptiles de Extremadura.
A partir de estos estudios, se empiezan a plantear acciones de conservación y seguimiento a largo plazo.
